De Academische Jaarprijs 2011 van 100.000 euro is gewonnen door het team Van Wezel van de Universiteit Leiden met hun project ‘Antibiotica gezocht’ dat onderdeel uitmaakt van het GenBiotics-programma van Stichting Toegepaste Wetenschappen (STW). De Labyrint Publieksprijs ging naar team Moerel van Maastricht.
FOM heeft de Minerva-Prijs 2011 toegekend aan prof. Maria Loi. De prijs is voor de beste wetenschappelijke publicatie van een vrouwelijke onderzoeker over een natuurkundig onderwerp in de afgelopen twee jaar.